Probabilités et évolution biologique
15 au 19 juin 2015
L’objectif fondamental de la conférence est de se faire l’écho des avancées méthodologiques et conceptuelles actuelles dans l’étude des processus stochastiques utilisés dans la modélisation en écologie, en génétique des populations et en évolution. L’objectif est de stimuler le développement de modèles stochastiques de pointe qui permettront une meilleure compréhension des processus d’évolution à diverses échelles, des gènes aux populations, communautés et écosystèmes. Les principaux problèmes mathématiques qui seront abordés peuvent être décrits par les thèmes suivants (et les interactions entre ceux-ci) :
– Comportement à grande échelle et événements rares dans la dynamique des populations
– Arbres, coalescents et processus historiques
– Processus de branchement généralisés
– Modèles spatiaux en écologie et en génétique des populations
– Réseaux aléatoires en épidémiologie

La conférence abordera l’étude de plusieurs phénomènes biologiques importants dans des domaines tels que l’épidémiologie, l’écologie, la génétique des populations et la phylogénie, en particulier les phénomènes à large échelle tels que les colonisations à longue portée, la macro-évolution de traits de vie, les arbres d’espèces, et les épidémies de maladies émergentes. L’étude de ces phénomènes soulève un bon nombre de questions profondes qui impliquent des structures mathématiques complexes et exigent l’introduction de nouveaux modèles et de nouvelles techniques de la théorie des probabilités. Un objectif essentiel de la conférence est donc de mettre en lumière l’étude d’outils mathématiques avancés, tout en gardant à l’esprit la réalité biologique et les applications potentielles dans les sciences de la vie.

Les interactions de la génétique et de l’écologie sont de première importance et méritent toujours plus d’attention aux échelles de la génétique des populations. La dépendance de la fitness individuelle par rapport à l’état de la population entière, et les interactions avec les conditions environnementales locales et globales sont des ingrédients essentiels de la modélisation. D’autres thèmes qui seront abordés dans la conférence, et qui font partie de la thématique de l’évolution biologique en un sens élargi, incluent les modèles de croissance des tumeurs, les modèles probabilistes de l’épidémiologie basés sur les outils de la dynamique des populations et des graphes aléatoires, ainsi que la génétique des populations de virus.


Comité scientifique

Matthias Birkner (Johannes-Gutenberg-Universität)
Alison Etheridge (University of Oxford)
Steve Evans (University of Berkeley)
Amaury Lambert (Université Paris 6)
Sylvie Méléard (Ecole Polytechnique)
John Wakeley (University of Harvard)

Comité d’organisation

Etienne Pardoux (Aix-Marseille Université)
Anton Wakolbinger (Goethe Universität, Frankfurt)

Conférenciers

  • Tibor Antal (Edinburgh University)

Multitype branching processes: from bacteria to cancer

  • Ellen Baake (Bielefeld University)

Ancestral selection graph meets lookdown construction

  • Vincent Bansaye (Ecole Polytechnique)

Coming down from infinity for some population models

  • Nick Barton (IST Austria) &  Alison Etheridge (Oxford University) 

Extending the infinitesimal model

  • Franz Baumdicker (University of Freiburg)  

The site frequency spectrum of dispensable gene sequences

  • Julien Berestycki (University of Oxford)

Branching processes with competition by pruning of Levy trees

  • Matthias Birkner (University of Mainz)  

Random walks in dynamic random environments and ancestry under local population regulation

  • Jochen Blath (TU Berlin)

Genetic variability under the seed bank coalescent

  • Anton Bovier (University of Bonn)  

Limits in adaptive dynamics

  • Éric Brunet (UPMC & ENS-Paris )

Existence of open evolutionary paths in a rugged landscape

  • Nicolas Champagnat (INRIA Nancy – Grand Est)  

The limit of small mutations in a stochastic individual-based model and the canonical equation of adaptive dynamics

  • Loren Coquille (University of Bonn) 

A stochastic individual-based model for immunotherapy of cancer

  • Michael Desai (Harvard University)  

Genetic diversity in the interference selection limit

  • Steven Evans (UC-Berkeley ) 

Recovering a tree from randomly sampled phylogenetic diversities

  • Adrian Gonzalez Casanova (TU-Berlin) & Linglong Yuan (Uppsala University)

An individual-based model for Lenski’s long-term evolution experiment

  • Paul Jenkins (University of Warwick) 

New evolutionary models for the long range dependencies of loosely linked loci

  • Stephen Krone (University of Idaho) 

Directed evolution of phage lysins: using mathematical models to explore feasibility/design of new antibacterial drugs

  • Joachim Krug (University of Cologne)  

Adaptive walks on correlated fitness landscapes

  • Denise Kuehnert (ETH Zürich)  

Phylodynamic analysis of rapidly evolving pathogens

  • Tom Kurtz (University of Wisconsin – Madison)  

Do it yourself lookdown constructions:  It is safe to build them at home

  • Michael Laessig (University of Cologne)

Adaptive evolution of  molecular quantitative traits

  • Amaury Lambert (Université Paris 6 )

A non exchangeable coalescent arising in phylogenetics

  • Sylvie Méléard (Ecole Polytechnique – Palaiseau)

Competitive populations with vertical and horizontal transmissions

  • Richard Neher (Max Planck Institute)

Quantifying and predicting the evolution of RNA viruses

  • Todd Parsons (Université Paris 6 )

Escaping from the Boundary in Density Dependent Population Processes.

  • Hermann-Helmut Pitters (University of Oxford)

The hydrodynamic limit for beta coalescents that come down from infinity

  • Emmanuel Schertzer LPMA (Université Paris 6 )

Genealogy of a branching process with overlapping generations

  • Aurelien Tellier (Technische Universität München)

Plant ecology influences population genetics: the role of seed banks in structuring genetic diversity

  • Amandine Véber (Ecole Polytechnique)

Genealogies with recombination in spatial population genetics